A Fatece reconhece o importante papel do meio acadêmico na fomentação da pesquisa, no aprimoramento do conhecimento e no desenvolvimento da ciência. Assim, a Instituição reserva especial atenção para as várias áreas da pesquisa científica e têm, como principais objetivos:

- elevar o padrão de qualidade dos seus cursos;

- continuar e intensificar o programa de atividades interdisciplinares, promovendo a integração do Ensino, da Pesquisa e da Extensão;

- fomentar as atividades de iniciação científica;

- implantar o Programa de Pesquisa Científica Docente;

- promover ações de integração com a comunidade externa;

- otimizar os trabalhos desenvolvidos através dos cursos e serviços, que levarão à comunidade os resultados de suas pesquisas.